Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde4bB1AWC9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde4bB1AWC9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde4bB1AWC9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde4bB1AWC9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde4bB1AWC9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde4bB1AWC9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde4bB1AWC9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde4bB1AWC9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde4bB1AWC9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde4bB1AWC9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde4bB1AWC9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pde4bB1AWC9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pde4bB1AWC9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pde4bB1AWC9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pde4bB1AWC9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms