Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhox1B1APN4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox1B1APN4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox1B1APN4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox1B1APN4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms