Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramef17A2ASJ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pramef17A2ASJ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramef17A2ASJ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pramef17A2ASJ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramef17A2ASJ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms