Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam43bA2AM80 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam43bA2AM80 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam43bA2AM80 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam43bA2AM80 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam43bA2AM80 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms