Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc163A2AGD7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc163A2AGD7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc163A2AGD7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc163A2AGD7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc163A2AGD7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms