Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Frmpd4A2AFR3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Frmpd4A2AFR3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Frmpd4A2AFR3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frmpd4A2AFR3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd4A2AFR3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms