Protein–RNA interactions for Protein: A2AD83

Frmd7, FERM domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd7A2AD83 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmd7A2AD83 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmd7A2AD83 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Frmd7A2AD83 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmd7A2AD83 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Frmd7A2AD83 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms