Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col9a3A2ACT7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a3A2ACT7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col9a3A2ACT7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col9a3A2ACT7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a3A2ACT7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms