Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssc4dA1L0T3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ssc4dA1L0T3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssc4dA1L0T3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssc4dA1L0T3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc4dA1L0T3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc4dA1L0T3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc4dA1L0T3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms