Protein–RNA interactions for Protein: A0JNT9

Bicdl1, BICD family-like cargo adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicdl1A0JNT9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Bicdl1A0JNT9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bicdl1A0JNT9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Bicdl1A0JNT9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Bicdl1A0JNT9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Bicdl1A0JNT9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms