Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cnga1P29974 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga1P29974 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms