Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kif3aP28741 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms