Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ggps1Q9WTN0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ggps1Q9WTN0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ggps1Q9WTN0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ggps1Q9WTN0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ggps1Q9WTN0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ggps1Q9WTN0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ggps1Q9WTN0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ggps1Q9WTN0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ggps1Q9WTN0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggps1Q9WTN0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggps1Q9WTN0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ggps1Q9WTN0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ggps1Q9WTN0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.9 ms