Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W5

Calcrl, Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcrlQ9R1W5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CalcrlQ9R1W5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CalcrlQ9R1W5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CalcrlQ9R1W5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CalcrlQ9R1W5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CalcrlQ9R1W5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms