Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed2Q9R0Q3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmed2Q9R0Q3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed2Q9R0Q3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmed2Q9R0Q3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms