Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcm1Q9R0L6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pcm1Q9R0L6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcm1Q9R0L6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms