Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZK7

Dok3, Docking protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok3Q9QZK7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dok3Q9QZK7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dok3Q9QZK7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dok3Q9QZK7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dok3Q9QZK7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dok3Q9QZK7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dok3Q9QZK7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dok3Q9QZK7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dok3Q9QZK7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dok3Q9QZK7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dok3Q9QZK7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Dok3Q9QZK7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Dok3Q9QZK7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Dok3Q9QZK7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Dok3Q9QZK7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Dok3Q9QZK7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Dok3Q9QZK7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dok3Q9QZK7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Dok3Q9QZK7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dok3Q9QZK7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms