Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp1Q9QY53 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Nphp1Q9QY53 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nphp1Q9QY53 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nphp1Q9QY53 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp1Q9QY53 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms