Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdcQ9QW08 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PdcQ9QW08 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PdcQ9QW08 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdcQ9QW08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms