Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prg3Q9JL95 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prg3Q9JL95 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prg3Q9JL95 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prg3Q9JL95 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prg3Q9JL95 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prg3Q9JL95 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms