Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gde1Q9JL56 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gde1Q9JL56 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gde1Q9JL56 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gde1Q9JL56 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gde1Q9JL56 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gde1Q9JL56 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gde1Q9JL56 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gde1Q9JL56 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gde1Q9JL56 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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