Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
Gde1Q9JL56 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Gde1Q9JL56 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Gde1Q9JL56 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Gde1Q9JL56 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Gde1Q9JL56 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Gde1Q9JL56 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Gde1Q9JL56 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Gde1Q9JL56 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gde1Q9JL56 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Gde1Q9JL56 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Gde1Q9JL56 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Gde1Q9JL56 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gde1Q9JL56 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Gde1Q9JL56 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Gde1Q9JL56 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Gde1Q9JL56 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gde1Q9JL56 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Gde1Q9JL56 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gde1Q9JL56 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Gde1Q9JL56 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gde1Q9JL56 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Gde1Q9JL56 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Gde1Q9JL56 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gde1Q9JL56 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gde1Q9JL56 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gde1Q9JL56 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gde1Q9JL56 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gde1Q9JL56 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Gde1Q9JL56 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Gde1Q9JL56 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Gde1Q9JL56 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gde1Q9JL56 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Gde1Q9JL56 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gde1Q9JL56 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gde1Q9JL56 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gde1Q9JL56 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Gde1Q9JL56 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gde1Q9JL56 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gde1Q9JL56 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Gde1Q9JL56 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Gde1Q9JL56 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gde1Q9JL56 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Gde1Q9JL56 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Gde1Q9JL56 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Gde1Q9JL56 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Gde1Q9JL56 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Gde1Q9JL56 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gde1Q9JL56 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gde1Q9JL56 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gde1Q9JL56 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gde1Q9JL56 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Gde1Q9JL56 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gde1Q9JL56 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gde1Q9JL56 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gde1Q9JL56 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Gde1Q9JL56 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Gde1Q9JL56 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Gde1Q9JL56 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gde1Q9JL56 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gde1Q9JL56 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Gde1Q9JL56 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gde1Q9JL56 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gde1Q9JL56 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Gde1Q9JL56 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gde1Q9JL56 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gde1Q9JL56 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Gde1Q9JL56 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gde1Q9JL56 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gde1Q9JL56 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gde1Q9JL56 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gde1Q9JL56 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gde1Q9JL56 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gde1Q9JL56 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gde1Q9JL56 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gde1Q9JL56 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Gde1Q9JL56 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gde1Q9JL56 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gde1Q9JL56 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gde1Q9JL56 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gde1Q9JL56 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gde1Q9JL56 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gde1Q9JL56 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gde1Q9JL56 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gde1Q9JL56 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gde1Q9JL56 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gde1Q9JL56 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gde1Q9JL56 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gde1Q9JL56 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gde1Q9JL56 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gde1Q9JL56 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gde1Q9JL56 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gde1Q9JL56 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gde1Q9JL56 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gde1Q9JL56 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Gde1Q9JL56 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Gde1Q9JL56 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Gde1Q9JL56 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gde1Q9JL56 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gde1Q9JL56 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
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