Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBN9

Ddx59, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX59, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx59Q9DBN9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx59Q9DBN9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx59Q9DBN9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx59Q9DBN9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx59Q9DBN9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms