Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SelenooQ9DBC0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SelenooQ9DBC0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SelenooQ9DBC0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SelenooQ9DBC0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms