Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9G3

Chic2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic2Q9D9G3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Chic2Q9D9G3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Chic2Q9D9G3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Chic2Q9D9G3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Chic2Q9D9G3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Chic2Q9D9G3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Chic2Q9D9G3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Chic2Q9D9G3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Chic2Q9D9G3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Chic2Q9D9G3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chic2Q9D9G3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chic2Q9D9G3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chic2Q9D9G3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chic2Q9D9G3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chic2Q9D9G3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Chic2Q9D9G3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Chic2Q9D9G3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Chic2Q9D9G3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Chic2Q9D9G3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Chic2Q9D9G3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Chic2Q9D9G3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Chic2Q9D9G3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chic2Q9D9G3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chic2Q9D9G3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Chic2Q9D9G3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Chic2Q9D9G3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Chic2Q9D9G3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Chic2Q9D9G3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Chic2Q9D9G3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Chic2Q9D9G3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Chic2Q9D9G3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chic2Q9D9G3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chic2Q9D9G3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chic2Q9D9G3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms