Protein–RNA interactions for Protein: Q9D832

Dnajb4, DnaJ homolog subfamily B member 4, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb4Q9D832 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajb4Q9D832 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajb4Q9D832 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajb4Q9D832 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajb4Q9D832 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajb4Q9D832 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajb4Q9D832 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajb4Q9D832 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajb4Q9D832 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajb4Q9D832 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajb4Q9D832 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajb4Q9D832 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajb4Q9D832 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajb4Q9D832 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajb4Q9D832 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajb4Q9D832 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dnajb4Q9D832 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dnajb4Q9D832 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajb4Q9D832 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb4Q9D832 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms