Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fip1l1Q9D824 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fip1l1Q9D824 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fip1l1Q9D824 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fip1l1Q9D824 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fip1l1Q9D824 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fip1l1Q9D824 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fip1l1Q9D824 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fip1l1Q9D824 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fip1l1Q9D824 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fip1l1Q9D824 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fip1l1Q9D824 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fip1l1Q9D824 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fip1l1Q9D824 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms