Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsmce1Q9D720 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nsmce1Q9D720 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsmce1Q9D720 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms