Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Taf1dQ9D4V4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Taf1dQ9D4V4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Taf1dQ9D4V4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Taf1dQ9D4V4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Taf1dQ9D4V4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Taf1dQ9D4V4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Taf1dQ9D4V4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Taf1dQ9D4V4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Taf1dQ9D4V4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Taf1dQ9D4V4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Taf1dQ9D4V4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Taf1dQ9D4V4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Taf1dQ9D4V4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Taf1dQ9D4V4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Taf1dQ9D4V4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Taf1dQ9D4V4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Taf1dQ9D4V4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms