Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sohlh2Q9D489 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sohlh2Q9D489 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sohlh2Q9D489 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 869.3 ms