Protein–RNA interactions for Protein: Q9D486

Cmip, C-Maf-inducing protein, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CmipQ9D486 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CmipQ9D486 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CmipQ9D486 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CmipQ9D486 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CmipQ9D486 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CmipQ9D486 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms