Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pus10Q9D3U0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pus10Q9D3U0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pus10Q9D3U0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pus10Q9D3U0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms