Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem53Q9D0Z3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem53Q9D0Z3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem53Q9D0Z3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms