Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ribc1Q9D0B8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ribc1Q9D0B8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ribc1Q9D0B8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ribc1Q9D0B8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ribc1Q9D0B8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ribc1Q9D0B8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ribc1Q9D0B8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms