Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PmpcbQ9CXT8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PmpcbQ9CXT8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PmpcbQ9CXT8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 310.1 ms