Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Npm3Q9CPP0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Npm3Q9CPP0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm3Q9CPP0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npm3Q9CPP0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Npm3Q9CPP0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms