Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab27bQ99P58 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab27bQ99P58 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab27bQ99P58 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab27bQ99P58 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms