Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SardhQ99LB7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SardhQ99LB7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SardhQ99LB7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SardhQ99LB7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SardhQ99LB7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SardhQ99LB7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SardhQ99LB7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SardhQ99LB7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SardhQ99LB7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SardhQ99LB7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SardhQ99LB7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SardhQ99LB7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SardhQ99LB7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SardhQ99LB7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SardhQ99LB7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms