Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Reep3Q99KK1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Reep3Q99KK1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Reep3Q99KK1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Reep3Q99KK1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Reep3Q99KK1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Reep3Q99KK1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Reep3Q99KK1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Reep3Q99KK1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Reep3Q99KK1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Reep3Q99KK1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Reep3Q99KK1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Reep3Q99KK1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Reep3Q99KK1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Reep3Q99KK1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Reep3Q99KK1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Reep3Q99KK1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Reep3Q99KK1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Reep3Q99KK1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Reep3Q99KK1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Reep3Q99KK1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Reep3Q99KK1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Reep3Q99KK1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Reep3Q99KK1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Reep3Q99KK1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms