Protein–RNA interactions for Protein: Q925J9

Med1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med1Q925J9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Med1Q925J9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Med1Q925J9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Med1Q925J9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Med1Q925J9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Med1Q925J9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Med1Q925J9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Med1Q925J9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Med1Q925J9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Med1Q925J9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Med1Q925J9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Med1Q925J9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Med1Q925J9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Med1Q925J9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Med1Q925J9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Med1Q925J9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Med1Q925J9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Med1Q925J9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Med1Q925J9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Med1Q925J9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Med1Q925J9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Med1Q925J9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Med1Q925J9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Med1Q925J9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Med1Q925J9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Med1Q925J9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Med1Q925J9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Med1Q925J9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Med1Q925J9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms