Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms