Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trub2Q91WG3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trub2Q91WG3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trub2Q91WG3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trub2Q91WG3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trub2Q91WG3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trub2Q91WG3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trub2Q91WG3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trub2Q91WG3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trub2Q91WG3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trub2Q91WG3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms