Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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