Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg8Q8VE18 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smg8Q8VE18 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg8Q8VE18 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg8Q8VE18 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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