Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sf3b4Q8QZY9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b4Q8QZY9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b4Q8QZY9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms