Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stn1Q8K2X3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stn1Q8K2X3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stn1Q8K2X3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stn1Q8K2X3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stn1Q8K2X3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stn1Q8K2X3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stn1Q8K2X3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stn1Q8K2X3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stn1Q8K2X3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stn1Q8K2X3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stn1Q8K2X3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Stn1Q8K2X3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stn1Q8K2X3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stn1Q8K2X3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stn1Q8K2X3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms