Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf13Q8K2W6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Phf13Q8K2W6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf13Q8K2W6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms