Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pnpt1Q8K1R3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnpt1Q8K1R3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnpt1Q8K1R3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms