Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc4a8Q8JZR6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc4a8Q8JZR6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc4a8Q8JZR6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc4a8Q8JZR6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc4a8Q8JZR6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slc4a8Q8JZR6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms