Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ClasrpQ8CFC7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClasrpQ8CFC7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClasrpQ8CFC7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClasrpQ8CFC7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClasrpQ8CFC7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClasrpQ8CFC7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClasrpQ8CFC7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClasrpQ8CFC7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ClasrpQ8CFC7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms